Ölüme mahkum edilmiş bir suçlu olan Callum Lynch Abstergo Industries adında çok zengin bir şirket tarafından ele geçirilir Şirketin büyük yatırım yaptığı Animus Projesi kişilerin atalarından kalan ve genlerine işlenmiş hatıra ve yeteneklerini ortaya çıkarmayı amaçlamaktadır...
