Allie Fox Ford Amerika da yaşayan bir bilim insanıdır Ancak yaşadığı ülkenin değerlerini gitgide kaybetmesi ve onun çalışmalarına hiç destek verilmemesi sonucu ülkesine karşı bir tepki duyar ve tüm ailesini alarak Honduras taki Sivrisinek Sahili ne gider...
Serinin bir önceki filminde uzay gemisi Atılgan ı kaçıran Kaptan Kirk ve mürettebatı dünyada yargılanmak üzeredir Ancak bu sırada uzaydan dünyaya gelen bir varlık dünyayı yok etme planları kurmaktadır Nedeni ise soyunun yıllar önce tükenmiş olmasıdır...
