Filmde Mario Luigi ve yeni arkadaşları Yoshi Prenses Peach ve Toad ile birlikte uzaya bir maceraya atılıyor ve burada Bowser ın oğlu Bowser Jr ile karşılaşıyor ve Prenses Rosalina ile tanışıyorlar...
Brooklyn li tesisatçılar Mario ve erkek kardeşi Luigi bir ana su borusunu tamir etmek için yeraltında çalışırken gizemli bir borudan aktarılarak sihirli yeni bir dünyaya girerler Ama kardeşler ayrı düşünce Mario Luigi yi bulmak için destansı bir maceraya çıkar...
