Filmde Prof. Lindenbrook, öğrencisi ve güzel bir kadın, dünyanın merkezine gidebilmek için tehlikeli bir yolculuğu göze alırlar. Yolda, kayıp kent Atlantis’i bulurlar. Kendilerini neyin beklediğini bilmeden yer altına doğru yol alırlarken ölüm, kaçırılma, sabotaj ve tarih öncesi hayvanların saldırısı gibi birçok tehlikeyle karşı karşıya kalırlar.