Babasının uzaylılara karşı kahramanca ölümü esnasında Jaeger pilotluğu eğitimini sürdüren Jake babasının vefatından sonra eğitimini sonlandırır Bir zamanların umut vadeden pilotuyken suç dünyasına bulaşan Jake e uzaklaştığı kız kardeşi Mako Mori tarafından son bir şans tanınır...
Kaiju olarak bilinen ve canavarlardan oluşan bir lejyon denizden yükselmeye başlayınca milyonlarca insanın ölümüne ve tüm yaşam kaynaklarının tükenmesine neden olan bir savaş başlar Dev Kaiju larla savaşmak için özel bir silah icat ediliir...