Bu komik macerada, sanayi casusları son derece gizli bir küçültme testi sırasında teknolojiyi çalınca işler tamamen sarpa sarar ve dünyanın ilk molekül büyüklüğündeki taşıtının cesur pilotu (Dennis Quaid) yanlışlıkla evhamlı bir satış elemanın (Martin Short) damarına enjekte edilir.
Sadece 24 saatlik oksijeni bulunan atom boyutundaki test pilotu vücudunda hapis kaldığı kişiyi çalınan teknolojiyi kurtarması için kahraman olacağına, ve sevgilisini de (Meg Ryan) onu sevdiğine inandırması ve her iki erkeği korkunç bir ölümden kurtarmasını sağlaması lazımdır.