Sevilen seriden yola çıkan bu yeni film dünyayı kötülüklerden arındırmaya çalışan ekibin bugüne kadar karşılarına çıkan en büyük tehdit olan köstebeği ortaya çıkarmak için kurdukları takımla birlikte verdikleri mücadeleyi konu ediyor...
Zamanda geriye giden bir uzaylı tarafından öldürülür ve dünya bir tehlikenin içine atılır Bu durumda Ajan J nin Will Smith zamanda geriye yolculuk yaparak cinayetin öncesine geri dönmesi ve Ajan K nın genç hali Josh Brolin ile onu dünyayı ve insanlığı kurtarmak için çalışması gerekmektedir...
İlk filmin başarısından sonra yönetmeninden oyuncularına aynı kadroyu koruyarak karşımıza çıkan Siyah Giyen Adamlar 2 de cool kahramanlarımız Kay ve Jay dört yıllık bir aradan sonra maceralarına geri dönüyorlar Bu dört yıllık sürede çok şey değişmiş...
Ellerinde hafıza silme cihazları ya da lazerli tabancalar gibi üstün teknolojiler bulunan ekibin ön plandaki iki üyesi olan siyah giyen adamlar dünyamızı dünya dışından gelme ihtimali olan terörist saldırılara karşı koruma amacındadırlar...